Daniel D Sommer

عدد مرات الاقتباسات

	الكل	قبل 2019
اقتباسات	15222	7747
h-index	17	13
i10-index	19	15

1700

850

425

1275

200920102011201220132014201520162017201820192020202120222023202451 104 172 299 746 938 1139 1227 1334 1305 1555 1522 1683 1419 1209 359

عدد المنشورات المتاحة للجميع

عرض المجموعة جميعها

19 مقالة

0 مقالة

المقالات البحثية المتاحة للجميع

المقالات البحثية غير المتاحة للجميع

تمّ اختيار المعلومات استنادًا إلى تفويضات التمويل

المؤلفون المشاركون

Mihai PopProfessor of Computer Science, University of Maryland, College Parkبريد إلكتروني تم التحقق منه على umd.edu
Steven SalzbergBloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins Universityبريد إلكتروني تم التحقق منه على jhu.edu
Todd J. TreangenAssociate Professor, Department of Computer Science, Rice Universityبريد إلكتروني تم التحقق منه على rice.edu
Sergey KorenAssociate Investigator, NHGRI/NIHبريد إلكتروني تم التحقق منه على nih.gov
Adam M. PhillippyDirector, Center for Genomics and Data Science Research, NHGRI, NIHبريد إلكتروني تم التحقق منه على nih.gov
Michael C. SchatzBloomberg Distinguished Professor, Johns Hopkins Universityبريد إلكتروني تم التحقق منه على cs.jhu.edu
Daniel SegrèProfessor at Boston University, Biology, Biomedical Engineering, Physics, Bioinformaticsبريد إلكتروني تم التحقق منه على bu.edu
O. Colin StineProfessor of Epidemiology and Public Health, Univeristy of Maryland Baltimoreبريد إلكتروني تم التحقق منه على umaryland.edu
Simon KasifProfessor of Biomedical Engineering, Computer Science and Bioinformatics, Boston Universityبريد إلكتروني تم التحقق منه على bu.edu
Niranjan NagarajanSenior Group Leader, Genome Institute of Singaporeبريد إلكتروني تم التحقق منه على gis.a-star.edu.sg
Timothy D ReadEmory Universityبريد إلكتروني تم التحقق منه على emory.edu
David R KelleyCalico Labsبريد إلكتروني تم التحقق منه على calicolabs.com
Bo LiuEngineering Manager of Data Infrastructure, Square

متابعة

Daniel D Sommer

National Biodefense Analysis and Countermeasures Center

بريد إلكتروني تم التحقق منه على nbacc.dhs.gov

Bioinformatics Genome Assembly Genome Annotation Taxonomic Classification


عنوان ترتيب حسب الاقتباسات ترتيب حسب السنة الترتيب حسب العنوان	عدد مرات الاقتباسات عدد مرات الاقتباسات	السنة
Structure, function and diversity of the healthy human microbiome‏ nature 486 (7402), 207-214, 2012‏	10078	2012
A framework for human microbiome research‏ Nature 486 (7402), 215-221, 2012‏	2374*	2012
Minimus: a fast, lightweight genome assembler‏ DD Sommer, AL Delcher, SL Salzberg, M Pop‏ BMC bioinformatics 8, 1-11, 2007‏	535	2007
Deep sequencing of the oral microbiome reveals signatures of periodontal disease‏ B Liu, LL Faller, N Klitgord, V Mazumdar, M Ghodsi, DD Sommer, ...‏ PloS one 7 (6), e37919, 2012‏	466	2012
Genome sequence and rapid evolution of the rice pathogen Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99^A‏ SL Salzberg, DD Sommer, MC Schatz, AM Phillippy, PD Rabinowicz, ...‏ BMC genomics 9, 1-16, 2008‏	424	2008
Next generation sequence assembly with AMOS‏ TJ Treangen, DD Sommer, FE Angly, S Koren, M Pop‏ Current Protocols in Bioinformatics 33 (1), 11.8. 1-11.8. 18, 2011‏	253	2011
Two new complete genome sequences offer insight into host and tissue specificity of plant pathogenic Xanthomonas spp‏ AJ Bogdanove, R Koebnik, H Lu, A Furutani, SV Angiuoli, PB Patil, ...‏ Journal of bacteriology 193 (19), 5450-5464, 2011‏	235	2011
MetAMOS: a modular and open source metagenomic assembly and analysis pipeline‏ TJ Treangen, S Koren, DD Sommer, B Liu, I Astrovskaya, B Ondov, ...‏ Genome biology 14, 1-20, 2013‏	223	2013
Genomic characterization of the Yersinia genus‏ PE Chen, C Cook, AC Stewart, N Nagarajan, DD Sommer, M Pop, ...‏ Genome biology 11, 1-18, 2010‏	124	2010
Comprehensive DNA signature discovery and validation‏ AM Phillippy, JA Mason, K Ayanbule, DD Sommer, E Taviani, A Huq, ...‏ PLoS computational biology 3 (5), e98, 2007‏	94	2007
Gene-boosted assembly of a novel bacterial genome from very short reads‏ SL Salzberg, DD Sommer, D Puiu, VT Lee‏ PLoS computational biology 4 (9), e1000186, 2008‏	74	2008
Hawkeye and AMOS: visualizing and assessing the quality of genome assemblies‏ MC Schatz, AM Phillippy, DD Sommer, AL Delcher, D Puiu, G Narzisi, ...‏ Briefings in bioinformatics 14 (2), 213-224, 2013‏	61	2013
De novo likelihood-based measures for comparing genome assemblies‏ M Ghodsi, CM Hill, I Astrovskaya, H Lin, DD Sommer, S Koren, M Pop‏ BMC research notes 6, 1-18, 2013‏	60	2013
Genome Sequence of the Wolbachia Endosymbiont of Culex quinquefasciatus JHB‏ SL Salzberg, D Puiu, DD Sommer, V Nene, NH Lee‏ Journal of bacteriology 191 (5), 1725-1725, 2009‏	60	2009
De novo assembly of large genomes using cloud computing‏ MC Schatz, D Sommer, D Kelley, M Pop‏ Proceedings of the Cold Spring Harbor Biology of Genomes Conference, 2010‏	57	2010
Biological sexing of a 4000-year-old Egyptian mummy head to assess the potential of nuclear DNA recovery from the most damaged and limited forensic specimens‏ O Loreille, S Ratnayake, AL Bazinet, TB Stockwell, DD Sommer, ...‏ Genes 9 (3), 135, 2018‏	44	2018
BLAST-based validation of metagenomic sequence assignments‏ AL Bazinet, BD Ondov, DD Sommer, S Ratnayake‏ PeerJ 6, e4892, 2018‏	22	2018
MetAMOS: a metagenomic assembly and analysis pipeline for AMOS‏ TJ Treangen, S Koren, I Astrovskaya, D Sommer, B Liu, M Pop‏ Genome Biology 12, 1-27, 2011‏	16	2011
Current progress and future opportunities in applications of bioinformatics for biodefense and pathogen detection: report from the Winter Mid-Atlantic Microbiome Meet-up …‏ JS Meisel, DJ Nasko, B Brubach, V Cepeda-Espinoza, J Chopyk, ...‏ Microbiome 6, 1-10, 2018‏	10	2018
Sequence-based predictions of lipooligosaccharide diversity in the Neisseriaceae and their implication in pathogenicity‏ DC Stein, CJ Miller, SV Bhoopalan, DD Sommer‏ PLoS One 6 (4), e18923, 2011‏	8	2011

يتعذر على النظام إجراء العملية في الوقت الحالي. عاود المحاولة لاحقًا.

مقالات 1–20

عدد الاقتباسات في العام

اقتباسات مكررة

الاقتباسات المدمجة

إضافة مؤلفين مشاركينالمؤلفون المشاركون

متابعة

عدد مرات الاقتباسات

المؤلفون المشاركون